RNA-seq

解析例：RNA-seq データから 2 群間発現比較

解析イメージ

6 サンプルの TPM 算出および 2 群間比較の価格

リードQC + アライメント + TPM 算出 + 任意の検定

2500 x 6 + 2500 x 6 + 3000 x 6 + 500 x 6 = 51000 円

お送りして頂くデータ

・ショートリード fastq/fasta ファイル

・リファレンスゲノム配列 fasta ファイル

・リファレンスゲノムに対応した遺伝子アノテーション gff3/gtf ファイル (なければオプションで作成可能)

納品データ

・リードクオリティデータ(平均リード長, リード数, etc)

・アライメント結果(平均 depth , ゲノムカバー率)

・bam ファイル

・遺伝子ごとのTPM 値一覧表

・統計処理結果一覧表

※ご希望のフォーマットでのファイル作成やオプションの解析も致します。

納期

QC 開始から 2 週間ぐらい

その他の解析と目安料金一覧

※リード QC およびアライメントを含む価格です。フォーマット変更やオプションの解析の内容によっては変動します。

上記以外にも、可能な限りご要望の解析を承ります。

見積もり・ご相談はお問合せ欄よりお願いいたします