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ゲノムシーケンス解析

解析例:SNP をコールして CAPS マーカー設計可能箇所を同定

解析イメージ

SNP解析.png

1サンプルあたりの価格

リードQC + アライメント + SNP コール + CAPS 可能な SNP コール

2500    +     2500      +     3000     +         1000       =    9000円

お送りして頂くデータ

・ショートリード fastq/fasta ファイル

・リファレンスゲノム配列 fasta ファイル

納品データ

・リードクオリティデータ(平均リード長, リード数, etc)

・アライメント結果(平均 depth , ゲノムカバー率)

・bam ファイル

・コールされた SNP 一覧表

・CAPS マーカー化可能な SNP 一覧表

※ご希望のフォーマットでのファイル作成やオプションの解析も致します。

納期

QC 開始から 2 週間ぐらい

その他の解析と目安料金一覧

※リード QC およびアライメントを含む価格です。フォーマット変更やオプションの解析の内容によっては変動します。

上記以外にも、ロングリード解析など、可能な限りご要望の解析を承ります。

見積もり・ご相談はお問合せ欄よりお願いいたします

次世代シーケンス解析ラボ

bioinfosegawa[@]gmail.com

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